32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3857 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  97.82 
 
 		 458 aa  824    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  89.74 
 
 		 445 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  887    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  70.56 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  74.48 
 
 		 450 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  69.27 
 
 		 442 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 449 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  43.58 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  43.19 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  42 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  42.22 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  42.28 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 439 aa  246  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  38.4 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  34.35 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  26.98 
 
 		 939 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  26.92 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  24.55 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  22.13 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  22.89 
 
 		 803 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  24.09 
 
 		 666 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.1 
 
 		 909 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 73 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  23.75 
 
 		 610 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  23.19 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>