23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46794 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  100 
 
 		 591 aa  1221    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  34.11 
 
 		 666 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  24.76 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  25.46 
 
 		 939 aa  67.8  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  23.66 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  24.26 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  23.91 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  23.65 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  22.92 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  23.81 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  21.75 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  23.4 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0069  ADP/ATP carrier protein  21.9 
 
 		 492 aa  54.3  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  22.51 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 448 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 427 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 427 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 449 aa  44.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  22.63 
 
 		 436 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 429 aa  43.9  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>