39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2661 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  86.52 
 
 		 427 aa  695    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  86.26 
 
 		 427 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  88.42 
 
 		 427 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  70.05 
 
 		 435 aa  584  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  68.28 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  54.63 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  55.24 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  56.13 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  52.69 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  55.32 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 448 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  42.26 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  40.89 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  42.92 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  42.76 
 
 		 458 aa  309  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  42.14 
 
 		 450 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  42.55 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  34.64 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  32.41 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  28.65 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  25.29 
 
 		 939 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  57.63 
 
 		 73 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  25.65 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  24.61 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  24.32 
 
 		 666 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  26.19 
 
 		 803 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0782  ADP, ATP carrier protein  21.77 
 
 		 543 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00645947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0929  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.73 
 
 		 1010 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.74 
 
 		 1056 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 526 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.05 
 
 		 539 aa  43.1  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.45 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>