32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4166 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  891    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  91.82 
 
 
445 aa  769    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  97.82 
 
 
458 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  70.11 
 
 
457 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  74.19 
 
 
450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  69.98 
 
 
442 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  46.86 
 
 
448 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  43.93 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  43.2 
 
 
427 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  43.06 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  43.75 
 
 
427 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  42.48 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  41.59 
 
 
438 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  41.57 
 
 
429 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  41.99 
 
 
439 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  41.63 
 
 
430 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  43.73 
 
 
436 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  39.74 
 
 
453 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 
439 aa  244  3e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  38.65 
 
 
441 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  34.9 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  43.53 
 
 
463 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  26.8 
 
 
939 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  26.52 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  24.09 
 
 
450 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  22.13 
 
 
529 aa  59.3  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  22.61 
 
 
803 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.1 
 
 
909 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  23.78 
 
 
666 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  37.5 
 
 
73 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  23.62 
 
 
610 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  23 
 
 
591 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>