32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4316 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  88.86 
 
 		 458 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  861    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  93.06 
 
 		 458 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  73.48 
 
 		 457 aa  624  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  78.45 
 
 		 450 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  71.03 
 
 		 442 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  42.89 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  43.76 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  41.82 
 
 		 430 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  42.72 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  40.69 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  39.4 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  35.73 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 463 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  27.79 
 
 		 939 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  27.35 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  24.37 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  22.28 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.04 
 
 		 909 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  25.32 
 
 		 803 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  23.43 
 
 		 666 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 73 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  24.37 
 
 		 591 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  22.65 
 
 		 610 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>