293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1527 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1527  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000128576  hitchhiker  0.00383137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.09 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.14 
 
 		 228 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.76 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.54 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1292  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.52 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  30.53 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 226 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 		 584 aa  60.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.37 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  32.69 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.17 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  29.75 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  28.99 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.64 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  23.57 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.58 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2686  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.38 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.640376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  28.99 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00630  thioredoxin reductase  33.02 
 
 		 570 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  23.4 
 
 		 245 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  34.31 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 241 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 		 227 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 229 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 		 225 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 236 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 246 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 876 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 		 286 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 		 413 aa  50.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.51 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  25.32 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.18 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 		 503 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 241 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.81 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  29.55 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 209 aa  48.5  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  30.22 
 
 		 622 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  33.71 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  33.71 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  34.69 
 
 		 266 aa  48.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  33.71 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 243 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 243 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>