278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0306 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  48.78 
 
 
164 aa  170  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  49.39 
 
 
167 aa  168  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  45.73 
 
 
167 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  29.73 
 
 
747 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  34.09 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.9 
 
 
243 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.94 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
412 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
226 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
456 aa  62.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  38.32 
 
 
226 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.06 
 
 
408 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
234 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  34.48 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.22 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.78 
 
 
220 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  31.06 
 
 
419 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.65 
 
 
225 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 
563 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.44 
 
 
322 aa  57.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.92 
 
 
462 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
594 aa  57.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
225 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 
229 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 
637 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
263 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
225 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 
231 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
246 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 
495 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.34 
 
 
238 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
226 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 
417 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 
286 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.99 
 
 
211 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2726  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.35 
 
 
322 aa  54.7  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.95 
 
 
225 aa  54.7  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 
227 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  29.5 
 
 
223 aa  54.3  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  24.38 
 
 
419 aa  54.3  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4265  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.61 
 
 
567 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  31.67 
 
 
449 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
243 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
236 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
275 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.93 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.81 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  25.97 
 
 
462 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.6 
 
 
487 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25.52 
 
 
225 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  26.39 
 
 
230 aa  52.4  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
225 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.82 
 
 
223 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.69 
 
 
413 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
250 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 
225 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.43 
 
 
224 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
225 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 
258 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 
226 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.27 
 
 
224 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3745  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0517034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1996  cAMP-binding protein  25.2 
 
 
1002 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  32.73 
 
 
144 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
224 aa  50.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
226 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.67 
 
 
1075 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
238 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  23.13 
 
 
482 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  27.59 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.45 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  22.86 
 
 
242 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.49 
 
 
231 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.28 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
503 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1337  cyclic nucleotide-binding protein  34.91 
 
 
463 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.79 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.53 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1177  cyclic nucleotide-binding  33.96 
 
 
463 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.706257  normal  0.0435994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 
811 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.52 
 
 
1018 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  29.33 
 
 
243 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.23 
 
 
561 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.09 
 
 
234 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>