177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1306 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 515 aa  1045    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 553 aa  123  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 537 aa  114  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  23.38 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  21.59 
 
 		 538 aa  97.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  22.12 
 
 		 558 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.98 
 
 		 555 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.08 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  32.8 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.97 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.39 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  22.78 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.11 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  27.37 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  20 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  20.11 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  21.03 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  19.96 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.33 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.67 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  22.62 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  26.54 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  31.63 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  28.66 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  21.45 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  30.81 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  27.81 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  21.33 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  28.41 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  28.41 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  30.71 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  20.95 
 
 		 501 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  21.9 
 
 		 740 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  25.44 
 
 		 365 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.21 
 
 		 364 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  21.57 
 
 		 381 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  20.85 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  28.67 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  25.11 
 
 		 287 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  29.32 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  28.12 
 
 		 575 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  31.36 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  35.29 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  18.83 
 
 		 505 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  32.05 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  29.05 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  47.06 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  47.06 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  47.06 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  35.4 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  30.57 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 586 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  27.4 
 
 		 637 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  45.65 
 
 		 431 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  25.14 
 
 		 518 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.97 
 
 		 486 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  26.22 
 
 		 554 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  24.9 
 
 		 371 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  30.14 
 
 		 639 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  23.26 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 514 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  33.73 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  25.82 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  35.29 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  25.62 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  32.1 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.82 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  35.29 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  35.29 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  28.12 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  27.01 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  23.72 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  31.62 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  25.71 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  29.2 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  22.46 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  28.07 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  23.12 
 
 		 647 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  20.74 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.11 
 
 		 665 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  27.06 
 
 		 389 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  31.97 
 
 		 326 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  32.31 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  26.32 
 
 		 535 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 414 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>