More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4080 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
738 aa  1429    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  51.12 
 
 
549 aa  323  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  34.5 
 
 
697 aa  198  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.12 
 
 
1045 aa  181  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.75 
 
 
952 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  36.34 
 
 
817 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 
1039 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 
744 aa  172  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.46 
 
 
579 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.91 
 
 
855 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.4 
 
 
573 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.28 
 
 
616 aa  163  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.94 
 
 
754 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.03 
 
 
591 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4200  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.91 
 
 
702 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00190608  normal  0.0466919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
713 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 
722 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.7 
 
 
775 aa  156  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 
1432 aa  155  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.5 
 
 
709 aa  154  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.24 
 
 
743 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 
716 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 
693 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 
776 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.01 
 
 
693 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.01 
 
 
745 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  28.6 
 
 
765 aa  141  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  31.16 
 
 
771 aa  140  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
1711 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  34.12 
 
 
546 aa  138  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.24 
 
 
672 aa  138  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 
688 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  36.18 
 
 
1017 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  40 
 
 
713 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  37.24 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.56 
 
 
688 aa  131  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.03 
 
 
700 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
1225 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 
544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.5 
 
 
697 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
905 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  26.32 
 
 
753 aa  127  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.05 
 
 
1051 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  36.6 
 
 
757 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.82 
 
 
525 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.04 
 
 
613 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 
676 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.74 
 
 
560 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  35.95 
 
 
652 aa  125  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 
607 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1361 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1390 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1390 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1390 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.78 
 
 
750 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.33 
 
 
851 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  33.92 
 
 
528 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
574 aa  121  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 
685 aa  121  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 
614 aa  121  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  37.44 
 
 
755 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
1385 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  31.54 
 
 
828 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.94 
 
 
538 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8733  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.18 
 
 
532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  38.68 
 
 
260 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.69 
 
 
529 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25 
 
 
1480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.08 
 
 
1087 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.28 
 
 
590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
727 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  34.75 
 
 
721 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
960 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.92 
 
 
1087 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  27.67 
 
 
746 aa  115  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 
692 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
710 aa  115  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  30.62 
 
 
585 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 
594 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  32.44 
 
 
932 aa  114  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 
627 aa  114  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 
1631 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 
643 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.1 
 
 
450 aa  114  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  31.83 
 
 
572 aa  114  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.17 
 
 
523 aa  114  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  36.09 
 
 
409 aa  114  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.52 
 
 
1646 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
866 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 
607 aa  111  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
809 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 
1651 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
797 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 
738 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.72 
 
 
957 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
987 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 
865 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.75 
 
 
585 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  35.2 
 
 
366 aa  108  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>