117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1283 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1283  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 450 aa  901    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000346676  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1353  extracellular solute-binding protein family 1  77.88 
 
 		 434 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  37.32 
 
 		 473 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.39 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.17 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.17 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  24.17 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.83 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.43 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.09 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.09 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.09 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.09 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.74 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  24.74 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.11 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.44 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.12 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  29.83 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.03 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  27.03 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.35 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.98 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.18 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.58 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.7 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2791  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.448693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0577  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 440 aa  46.6  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  27.95 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 440 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.92 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  18.93 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.26 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3873  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>