111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2149 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  100 
 
 		 629 aa  1209    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.54 
 
 		 1432 aa  158  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1612 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  26.5 
 
 		 995 aa  135  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1036 aa  120  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.17 
 
 		 836 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  30.91 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  24 
 
 		 1299 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.49 
 
 		 493 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.96 
 
 		 557 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  25.83 
 
 		 562 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  27.59 
 
 		 518 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1154 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  20.39 
 
 		 974 aa  100  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1147 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.06 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.83 
 
 		 1076 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1426 aa  94  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.5 
 
 		 416 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.34 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  18.07 
 
 		 1058 aa  82  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  17.94 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  22 
 
 		 1132 aa  80.9  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1209 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  20.88 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1338 aa  78.2  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 694 aa  77.4  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  22.78 
 
 		 1159 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  20.97 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  32.47 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  27.48 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1177 aa  70.9  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.45 
 
 		 1244 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  28.99 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 		 673 aa  67  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.18 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  19.1 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.64 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  30.94 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  17.54 
 
 		 1020 aa  65.1  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  29.96 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.22 
 
 		 1186 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  20.6 
 
 		 1257 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  29.26 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  27.34 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  30.4 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  19.17 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  21.05 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  23.53 
 
 		 1285 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  26.06 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  34.51 
 
 		 950 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.56 
 
 		 1170 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  17.58 
 
 		 1256 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  27.53 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.1 
 
 		 1252 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  30.9 
 
 		 587 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.41 
 
 		 527 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  29.57 
 
 		 652 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  22.39 
 
 		 1189 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.47 
 
 		 489 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.19 
 
 		 1194 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.88 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  28.7 
 
 		 389 aa  52  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.7 
 
 		 746 aa  50.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 		 578 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.84 
 
 		 1134 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3396  type I restriction enzyme M protein  25.98 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 		 578 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  25.91 
 
 		 515 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2227  hypothetical protein  26.1 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1125 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1184 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1210 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1497 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1104 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  29.31 
 
 		 792 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.26 
 
 		 827 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  48.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 523 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  22.81 
 
 		 455 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.75 
 
 		 570 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.67 
 
 		 926 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 584 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 515 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 523 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  27.06 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  44.78 
 
 		 816 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 657 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 523 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 495 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  24.67 
 
 		 527 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  22.98 
 
 		 1343 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.03 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  25.45 
 
 		 508 aa  45.8  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  27.08 
 
 		 1160 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1218  N-6 DNA methylase  27.12 
 
 		 544 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0823  N-6 DNA methylase  27.35 
 
 		 768 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0181192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  22.41 
 
 		 480 aa  45.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  31.51 
 
 		 449 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>