157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0015 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  48.57 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  52.11 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  44.94 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  47.89 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  52.24 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  47.76 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  40 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  45.45 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  46.15 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  33.87 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  40.74 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  33.06 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  46.15 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  31.03 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.51 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  41.94 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.55 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  42.5 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  46.77 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.41 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  44.26 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  44.26 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  43.75 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.03 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  43.55 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  45.76 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  45.76 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.03 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.21 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.99 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.24 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.54 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.3 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  41.89 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  40.85 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  41.67 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  40.85 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  40.98 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  42.37 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  45.71 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.94 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.26 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  42.37 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  41.27 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  53.7 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  25.42 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.28 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  38.03 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  37.1 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  35.82 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  37.88 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  43.1 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  35.29 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  37.18 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  48.21 
 
 		 166 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.32 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.51 
 
 		 164 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  46.48 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  52.31 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  34.44 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  34.33 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  26.28 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  29.94 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  26.28 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.96 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  46.67 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.76 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.91 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.44 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  38.71 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.99 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.68 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  51.72 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.58 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.1 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  35.48 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  37.7 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  43.55 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  35.37 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.58 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  42.86 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  44.64 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.23 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  28.79 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  37.88 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  37.5 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  36.84 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.53 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  39.39 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.23 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  33.33 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  44.23 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  39.66 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>