More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0322 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  100 
 
 
379 aa  789  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  32.43 
 
 
402 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.71 
 
 
393 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.82 
 
 
411 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.08 
 
 
388 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.87 
 
 
400 aa  148  1e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.8 
 
 
397 aa  146  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.35 
 
 
397 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29 
 
 
384 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  28.3 
 
 
376 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.5 
 
 
384 aa  142  1e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  28.03 
 
 
376 aa  142  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 
376 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.13 
 
 
396 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  28.42 
 
 
376 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.46 
 
 
434 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.61 
 
 
482 aa  135  1e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.63 
 
 
463 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.99 
 
 
401 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.51 
 
 
467 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.36 
 
 
412 aa  122  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.79 
 
 
368 aa  121  2e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.23 
 
 
401 aa  120  4e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.91 
 
 
412 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  34.45 
 
 
251 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  25.95 
 
 
401 aa  119  1e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.88668e-10  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  25.95 
 
 
401 aa  118  1e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  26.6 
 
 
399 aa  118  1e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  32.9 
 
 
334 aa  118  1e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  24.74 
 
 
400 aa  118  2e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  29.79 
 
 
347 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  29.79 
 
 
347 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.19 
 
 
399 aa  116  7e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.19 
 
 
415 aa  116  8e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.92 
 
 
353 aa  116  8e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.19 
 
 
415 aa  116  8e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.26 
 
 
399 aa  115  1e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.1 
 
 
399 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  29.32 
 
 
414 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.02 
 
 
359 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.01 
 
 
407 aa  112  7e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.62 
 
 
400 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  24.87 
 
 
400 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.62 
 
 
400 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.39 
 
 
400 aa  112  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.24 
 
 
337 aa  111  2e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.67 
 
 
351 aa  111  2e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  25.27 
 
 
444 aa  111  2e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.22 
 
 
421 aa  111  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.67 
 
 
351 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  23.12 
 
 
399 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.14 
 
 
367 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.15 
 
 
429 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  26.01 
 
 
451 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.94 
 
 
387 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.89 
 
 
412 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  26.89 
 
 
392 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.13 
 
 
412 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.74 
 
 
381 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.46 
 
 
354 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.04 
 
 
414 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.46 
 
 
354 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.87 
 
 
361 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 
404 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.6 
 
 
390 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  25.33 
 
 
377 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.59 
 
 
410 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.55 
 
 
378 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 
409 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.62 
 
 
372 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.2 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  23.35 
 
 
452 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.01 
 
 
370 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  24.85 
 
 
420 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  28.14 
 
 
409 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.07 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.35 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  28.14 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  23.56 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  26.4 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  24.43 
 
 
451 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.79 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.07 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.37 
 
 
275 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.4 
 
 
409 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.62 
 
 
295 aa  96.3  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.43 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  31.33 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  26.78 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.87 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  30.04 
 
 
337 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  29.57 
 
 
362 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.43 
 
 
444 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  31.25 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.68 
 
 
432 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.35 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.71 
 
 
294 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  39.31 
 
 
159 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>