More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0338 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  100 
 
 		 562 aa  1125    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  47.49 
 
 		 571 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  47.49 
 
 		 571 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  47.49 
 
 		 571 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  47.49 
 
 		 571 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  47.49 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  47.13 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  50.95 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  45.49 
 
 		 551 aa  435  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  44.68 
 
 		 529 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  40.52 
 
 		 532 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  38.97 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.83 
 
 		 474 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.46 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.39 
 
 		 474 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  35.25 
 
 		 509 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  37.61 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  34.43 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  33.07 
 
 		 520 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.82 
 
 		 486 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.01 
 
 		 523 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  33.94 
 
 		 592 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  32.6 
 
 		 520 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.4 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35 
 
 		 519 aa  224  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  30.9 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  32.53 
 
 		 539 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.06 
 
 		 520 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.21 
 
 		 522 aa  220  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.92 
 
 		 565 aa  220  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  31.96 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.59 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.62 
 
 		 522 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.03 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.16 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.76 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  30.36 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  31.01 
 
 		 561 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  30.6 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  31.68 
 
 		 568 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  30.66 
 
 		 598 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  29.42 
 
 		 551 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  44.44 
 
 		 234 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  31.86 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  29.18 
 
 		 551 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.43 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  29.33 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.94 
 
 		 561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  31.42 
 
 		 565 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  31.14 
 
 		 561 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  31.08 
 
 		 536 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  34.25 
 
 		 765 aa  157  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  28.1 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.45 
 
 		 526 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  28.94 
 
 		 596 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.54 
 
 		 567 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.66 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.64 
 
 		 542 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  28.31 
 
 		 485 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.33 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.64 
 
 		 569 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.48 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.51 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.28 
 
 		 613 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.12 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.06 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  24.4 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.5 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  23.71 
 
 		 560 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.74 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.23 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.83 
 
 		 526 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.48 
 
 		 509 aa  94.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.54 
 
 		 550 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.92 
 
 		 526 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.24 
 
 		 483 aa  92  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.1 
 
 		 464 aa  92  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.43 
 
 		 892 aa  92  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.59 
 
 		 513 aa  91.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  24.72 
 
 		 523 aa  91.3  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  23.5 
 
 		 505 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.63 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  21.33 
 
 		 461 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.3 
 
 		 597 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.47 
 
 		 488 aa  87.8  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 489 aa  86.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  22.77 
 
 		 581 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.21 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  24.73 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  23.64 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  28.23 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.76 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.56 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.56 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.76 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.76 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.76 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>