More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4783 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  57.75 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  56.32 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  52.88 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  51.83 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  48.68 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  40.53 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  35.12 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  37.62 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  34.86 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  34.17 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  32.12 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  26.94 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  29.49 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  29.47 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  28.07 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.24 
 
 		 517 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  27.15 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 		 521 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  24.09 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  26.51 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  26.07 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  31.02 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  20.73 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.56 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  24.46 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  27.31 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.49 
 
 		 319 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  22.8 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  29.01 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  26.27 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  30.27 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  29.46 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  24.5 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  24.02 
 
 		 600 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  34.32 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  24.44 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  26.28 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 		 710 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.74 
 
 		 846 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  33.83 
 
 		 1033 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  20.79 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  23.81 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.25 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  39.76 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 14916 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  24.68 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  33.93 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25.52 
 
 		 844 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 727 aa  55.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  23.95 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  28.41 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  29.07 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  29.48 
 
 		 870 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  24.07 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 381 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 452 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 872 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 363 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>