More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3470 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  100 
 
 
430 aa  881  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  62.13 
 
 
435 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.01957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  56.97 
 
 
427 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  55.06 
 
 
429 aa  484  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.0948e-15  normal 
 
 
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  52.44 
 
 
432 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  53.9 
 
 
407 aa  446  1e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  54.15 
 
 
407 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  44.11 
 
 
443 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  39.37 
 
 
457 aa  272  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40.87 
 
 
438 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.69838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.62 
 
 
444 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.57607e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  35.63 
 
 
444 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.50977e-07  decreased coverage  9.15698e-05 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  37.59 
 
 
440 aa  259  5e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  42.48 
 
 
445 aa  256  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  39.71 
 
 
440 aa  254  2e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.1437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  40.24 
 
 
442 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  38.89 
 
 
450 aa  244  2e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  37.87 
 
 
449 aa  236  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  37.87 
 
 
441 aa  236  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.57042e-08  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  38.62 
 
 
434 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  38.62 
 
 
434 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  38.62 
 
 
434 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.3 
 
 
415 aa  226  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  33.03 
 
 
428 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.38 
 
 
450 aa  223  5e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  32.69 
 
 
421 aa  221  2e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  33.64 
 
 
436 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  34.69 
 
 
450 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.49 
 
 
450 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  35.02 
 
 
446 aa  216  6e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.34 
 
 
428 aa  215  1e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  34.84 
 
 
437 aa  214  2e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  32.05 
 
 
435 aa  213  4e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.93 
 
 
429 aa  213  5e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  36.25 
 
 
444 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  36.25 
 
 
444 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  34.34 
 
 
462 aa  212  8e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.97 
 
 
427 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.42 
 
 
446 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.77 
 
 
432 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  32.02 
 
 
435 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  35.17 
 
 
439 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  33.25 
 
 
444 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.59 
 
 
425 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  35.05 
 
 
444 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  33.25 
 
 
450 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  33.01 
 
 
449 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  34.49 
 
 
439 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  32.4 
 
 
451 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.42 
 
 
437 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.16 
 
 
428 aa  207  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.46 
 
 
426 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  31 
 
 
443 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  34.25 
 
 
441 aa  206  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.24 
 
 
427 aa  206  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  34.17 
 
 
446 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.28 
 
 
430 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.72 
 
 
434 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.82 
 
 
445 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.95 
 
 
428 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.49 
 
 
438 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.44 
 
 
441 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  30.32 
 
 
443 aa  204  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  33.16 
 
 
461 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  32.28 
 
 
449 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.5 
 
 
430 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  30.09 
 
 
443 aa  202  1e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  30.24 
 
 
443 aa  201  2e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  33.91 
 
 
443 aa  201  2e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  30.24 
 
 
440 aa  201  2e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.79 
 
 
434 aa  200  4e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.05 
 
 
421 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  33.72 
 
 
441 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  33.53 
 
 
422 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  30.28 
 
 
430 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.53 
 
 
422 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.46 
 
 
408 aa  199  8e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.88 
 
 
435 aa  197  2e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.45 
 
 
434 aa  197  2e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  30.72 
 
 
432 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.36659e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  34.04 
 
 
435 aa  197  4e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.24 
 
 
450 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  37.03 
 
 
438 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  30.73 
 
 
414 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  30.23 
 
 
433 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  29.72 
 
 
432 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  30.23 
 
 
424 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  28.8 
 
 
432 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  29.6 
 
 
423 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  30.23 
 
 
433 aa  191  3e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  29.53 
 
 
433 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.3 
 
 
436 aa  191  3e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.4 
 
 
442 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  29.6 
 
 
423 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  29.6 
 
 
423 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.75 
 
 
431 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  30.72 
 
 
439 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.81 
 
 
403 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  33.76 
 
 
461 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  30.14 
 
 
431 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>