More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2712 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 204 aa  427  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  46.23 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  40.39 
 
 		 1099 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  42.79 
 
 		 1101 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 		 752 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  38.69 
 
 		 264 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  40.21 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  38.17 
 
 		 324 aa  151  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 		 1120 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  43.01 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  43.37 
 
 		 241 aa  148  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  39.25 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 		 1154 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  40.93 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  39.06 
 
 		 241 aa  147  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  40.7 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  40.11 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  41.71 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  37.68 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  38.61 
 
 		 244 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  41.97 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 305 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 405 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 		 465 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  38.38 
 
 		 320 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 1118 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  37.69 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  38 
 
 		 368 aa  141  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  37.56 
 
 		 1115 aa  138  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.56 
 
 		 1115 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.56 
 
 		 1119 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  37.56 
 
 		 927 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 1124 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  40.51 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.06 
 
 		 1115 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.56 
 
 		 1115 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 263 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 259 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 302 aa  134  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.89 
 
 		 440 aa  134  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.78 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  36.7 
 
 		 279 aa  132  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  36.04 
 
 		 872 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 317 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3002  polysaccharide deacetylase  39 
 
 		 354 aa  131  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.885061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.61 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 413 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  38.38 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  38.03 
 
 		 479 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  38.31 
 
 		 479 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 291 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 503 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04760  predicted xylanase/chitin deacetylase  35.96 
 
 		 573 aa  125  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000622168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 352 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  35.64 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  36.13 
 
 		 373 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  34.44 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 261 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  33.16 
 
 		 373 aa  122  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 404 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  34.54 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 		 317 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  36.32 
 
 		 468 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  37.44 
 
 		 481 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.02 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  34.5 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.33 
 
 		 256 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  34.55 
 
 		 275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  32.07 
 
 		 364 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 		 683 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  32.8 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3360  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0110446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 227 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  37.76 
 
 		 291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  36.36 
 
 		 488 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>