124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2454 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 686 aa  1302    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  41.86 
 
 		 829 aa  350  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  36.46 
 
 		 859 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  34.87 
 
 		 900 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.45 
 
 		 675 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 1000 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.5 
 
 		 897 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  35.83 
 
 		 992 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  34.2 
 
 		 899 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.79 
 
 		 1324 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 		 1056 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1383 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  30.47 
 
 		 934 aa  170  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  30.03 
 
 		 1500 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  29.06 
 
 		 1311 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  29.05 
 
 		 1309 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  27.22 
 
 		 1314 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  28.96 
 
 		 845 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1068 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.07 
 
 		 843 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  26.95 
 
 		 1509 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 911 aa  136  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  26.96 
 
 		 838 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.64 
 
 		 963 aa  132  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1039 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 785 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1523 aa  124  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.45 
 
 		 849 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  29.32 
 
 		 801 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 1262 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  22.94 
 
 		 1146 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1105 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.23 
 
 		 713 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 1050 aa  104  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 814 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.82 
 
 		 1128 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 857 aa  101  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 		 1185 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  41.46 
 
 		 358 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1088 aa  94.7  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  32.95 
 
 		 373 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.18 
 
 		 1131 aa  94  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.6 
 
 		 1125 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 924 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  27.91 
 
 		 1326 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  25 
 
 		 1261 aa  92.8  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.85 
 
 		 1424 aa  91.3  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  29.39 
 
 		 828 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.23 
 
 		 1228 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  27.69 
 
 		 1488 aa  87.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  23.9 
 
 		 672 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27 
 
 		 793 aa  84  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  28.94 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 1288 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 776 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 767 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  28.81 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 843 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1283 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 953 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 568 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 568 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  30.89 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1010 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1215 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 1186 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.32 
 
 		 1328 aa  67.8  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.67 
 
 		 1404 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 640 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  30.46 
 
 		 1475 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 966 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.81 
 
 		 841 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 991 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.14 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 919 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  19.55 
 
 		 1212 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  30.2 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.52 
 
 		 822 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.368584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 1290 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  25.85 
 
 		 958 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  25.57 
 
 		 633 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 652 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  22.66 
 
 		 680 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1017 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  29.58 
 
 		 731 aa  53.9  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 837 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 671 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 		 885 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 771 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 949 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  33.33 
 
 		 1106 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>