106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21130  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.368584 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 1288 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 1262 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 444 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 1050 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1105 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.91 
 
 		 1131 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.18 
 
 		 828 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  27.63 
 
 		 1475 aa  68.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 		 1185 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 1128 aa  67.8  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 1324 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.07 
 
 		 1056 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 767 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 1125 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  33.08 
 
 		 1500 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 924 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.26 
 
 		 1488 aa  61.6  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 953 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.32 
 
 		 841 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 776 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1215 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.48 
 
 		 1424 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1068 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.22 
 
 		 672 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 568 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 568 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1383 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 911 aa  58.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.09 
 
 		 1328 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 686 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 814 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 1186 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.21 
 
 		 801 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.07 
 
 		 899 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  33.02 
 
 		 686 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  29.2 
 
 		 897 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 843 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 837 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  26.45 
 
 		 675 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.38 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 725 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 751 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 		 1040 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 829 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  29.14 
 
 		 1311 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 		 885 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 1290 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 		 304 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 		 1146 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.5 
 
 		 825 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 919 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 949 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.57 
 
 		 963 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 787 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 771 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  22.29 
 
 		 694 aa  51.2  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1283 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08563  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 326 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 857 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  22.3 
 
 		 1106 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  26.56 
 
 		 1468 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  22.15 
 
 		 845 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  22.52 
 
 		 919 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  29.08 
 
 		 859 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.81 
 
 		 493 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  27.08 
 
 		 838 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 785 aa  48.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 		 843 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  29.75 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  20.71 
 
 		 2413 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 991 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47294  predicted protein  25.45 
 
 		 777 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  25.68 
 
 		 1314 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.48 
 
 		 1136 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  25.44 
 
 		 311 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1658  Tetratricopeptide TPR_4  26.27 
 
 		 405 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856151  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  25.32 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 481 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 443 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1010 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  26.24 
 
 		 900 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 966 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1359  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 333 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  30.23 
 
 		 1731 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.44 
 
 		 1228 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 1109 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1523 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.28 
 
 		 732 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 900 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.79 
 
 		 713 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>