79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1658 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1658  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 405 aa  808    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856151  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  43.44 
 
 		 958 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 		 1262 aa  87.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 776 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.65 
 
 		 828 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  25.96 
 
 		 963 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.92 
 
 		 1050 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 1128 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 837 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.76 
 
 		 1056 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1039 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 1288 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  28 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.64 
 
 		 1488 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 1185 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  24.85 
 
 		 845 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1105 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.5 
 
 		 1131 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 1283 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 911 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 924 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  32.07 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 		 667 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.65 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 577 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.78 
 
 		 1146 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 		 885 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.08 
 
 		 919 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.25 
 
 		 1125 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.25 
 
 		 854 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.02 
 
 		 822 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  21.39 
 
 		 311 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.91 
 
 		 1328 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  25.33 
 
 		 1324 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 953 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 785 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 1424 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  29.31 
 
 		 1468 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 814 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 767 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.5 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 787 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1068 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.68 
 
 		 771 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.5 
 
 		 1475 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  28.51 
 
 		 686 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 212 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3751  ATP/GTP-binding protein  25.75 
 
 		 702 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 190 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 991 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1902  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 857 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  23.03 
 
 		 713 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 1435 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.47 
 
 		 672 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1530  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1215 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 843 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 751 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 304 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21130  hypothetical protein  26.27 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.368584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 1290 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  24.31 
 
 		 900 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  24.32 
 
 		 897 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.77 
 
 		 1507 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  25.19 
 
 		 1314 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 		 841 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 1186 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.56 
 
 		 799 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00971  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79028]  33.01 
 
 		 124 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.298424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.22 
 
 		 680 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>