More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4628 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 235 aa  134  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  29.31 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  38.24 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  38.24 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  38.24 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  38.24 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  38.24 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  37.5 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  37.5 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  39.34 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 446 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  40.74 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>