More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1759 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  72.98 
 
 
472 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
472 aa  948    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  59.92 
 
 
477 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  61.8 
 
 
472 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  62.61 
 
 
472 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  56.46 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 
477 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  42.98 
 
 
479 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  44.49 
 
 
475 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  46.1 
 
 
492 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  44.66 
 
 
472 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  42.98 
 
 
479 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 
488 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  44.88 
 
 
472 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  45.86 
 
 
488 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  45.05 
 
 
475 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  44.23 
 
 
472 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  43.61 
 
 
479 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 
479 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  44.23 
 
 
472 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  44.23 
 
 
472 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  43.59 
 
 
472 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  43.59 
 
 
472 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  43.8 
 
 
472 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
472 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.18 
 
 
487 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  43.59 
 
 
472 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  44.3 
 
 
487 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  43.38 
 
 
472 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  44.08 
 
 
487 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  43.36 
 
 
482 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  42.37 
 
 
473 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  43.68 
 
 
479 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  43.33 
 
 
465 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
494 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  39.96 
 
 
471 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  44.16 
 
 
469 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
471 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  43.49 
 
 
494 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  39.43 
 
 
475 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  35.48 
 
 
466 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
458 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
456 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.41 
 
 
487 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.33 
 
 
485 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  32.44 
 
 
485 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.58 
 
 
487 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.58 
 
 
487 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.58 
 
 
487 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.21 
 
 
485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  31.42 
 
 
448 aa  221  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.08 
 
 
464 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
448 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.13 
 
 
462 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  34.12 
 
 
474 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.72 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.91 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.07 
 
 
470 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  32.04 
 
 
430 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.94 
 
 
474 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
459 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.45 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.7 
 
 
474 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
472 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.54 
 
 
450 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.71 
 
 
473 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.76 
 
 
447 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
459 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.33 
 
 
462 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
462 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.49 
 
 
472 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  29.41 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.51 
 
 
476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
466 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.57 
 
 
455 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.98 
 
 
474 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
460 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
451 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.84 
 
 
467 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.93 
 
 
459 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.22 
 
 
474 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.91 
 
 
455 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  30.27 
 
 
459 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.25 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.04 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.57 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  29.78 
 
 
459 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
459 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.82 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
459 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
451 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.18 
 
 
462 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  30.58 
 
 
468 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>