132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1065 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  45.41 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  46.51 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.22 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  42.18 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  41.89 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  36.56 
 
 		 236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  31.9 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  33.33 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29.95 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29.95 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.18 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  30.05 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.53 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.91 
 
 		 235 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.39 
 
 		 247 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.39 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  32.81 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.85 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  31.55 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  32.59 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  28.51 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  28.38 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  25.94 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  29.57 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  28.23 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  31.11 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  31.12 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.84 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.85 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.14 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  34.07 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  30.19 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.26 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.27 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  27.81 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  29.65 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.01 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  25.74 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  28.25 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.23 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  28.15 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.48 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.37 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  27.69 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  32.98 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  25.78 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.32 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  28.57 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  25.13 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  28.97 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  32.54 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.82 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  32.65 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  28.57 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  31.25 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  27.89 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  28.57 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  32.02 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  22.43 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  25.4 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.14 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  29.02 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  27.46 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  26.34 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  24.64 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  32.03 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  24.09 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  26.94 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.87 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3355  hypothetical protein  38.1 
 
 		 90 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.791337  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  37.1 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  23.97 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  29.55 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  28.46 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  25.71 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  23.25 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  29.41 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  22.9 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  35.37 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25.1 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  24.64 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  25.41 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  30 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  27.46 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  28.75 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  23.7 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  23.47 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  27.14 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>