276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5582 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  50.69 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  53.54 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  53.92 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  47.35 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  35.4 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.59 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.95 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.24 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.4 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  27.8 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  29.88 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  33.77 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  43.82 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  27.49 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  27.49 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  27.49 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  30.18 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  33.54 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.39 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.65 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  28.32 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>