More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4378 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 224 aa  95.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.89 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.08 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  33.52 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.86 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.42 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>