97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4328 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39.56 
 
 		 3391 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  100 
 
 		 2193 aa  4205    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  36.52 
 
 		 1699 aa  562  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  55.72 
 
 		 5899 aa  489  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  39.59 
 
 		 1631 aa  337  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  30.24 
 
 		 2890 aa  324  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.96 
 
 		 5787 aa  241  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  24.8 
 
 		 3544 aa  180  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.04 
 
 		 3699 aa  170  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  51.02 
 
 		 4480 aa  154  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  31.38 
 
 		 4723 aa  144  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  23.1 
 
 		 3699 aa  142  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  54.55 
 
 		 1092 aa  140  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38 
 
 		 3323 aa  134  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  33.58 
 
 		 1323 aa  122  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  35 
 
 		 1421 aa  117  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.5 
 
 		 3927 aa  117  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  55.83 
 
 		 2156 aa  112  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  55.86 
 
 		 3066 aa  110  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  35.96 
 
 		 1134 aa  108  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.1 
 
 		 2552 aa  108  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  26.67 
 
 		 1867 aa  107  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  50.45 
 
 		 1526 aa  94  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.14 
 
 		 1883 aa  87.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  37.31 
 
 		 1827 aa  86.7  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  31.48 
 
 		 2251 aa  86.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  26.37 
 
 		 3824 aa  84.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  39.42 
 
 		 1202 aa  82  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  26.51 
 
 		 3739 aa  80.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  26.34 
 
 		 3824 aa  80.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  26.76 
 
 		 3824 aa  79.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  26.6 
 
 		 2522 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  26.82 
 
 		 3721 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  39.41 
 
 		 1014 aa  75.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  36.13 
 
 		 781 aa  74.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  40.31 
 
 		 3864 aa  74.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  40.31 
 
 		 4830 aa  73.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  44.23 
 
 		 7434 aa  73.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  27.06 
 
 		 1462 aa  72  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  41.74 
 
 		 873 aa  72  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.73 
 
 		 1779 aa  70.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  38.58 
 
 		 846 aa  70.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.64 
 
 		 1428 aa  70.5  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  41.59 
 
 		 918 aa  70.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 3193 aa  69.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  23.53 
 
 		 2402 aa  69.3  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  40.71 
 
 		 1196 aa  69.3  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  34.19 
 
 		 819 aa  68.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 		 4231 aa  68.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  29.74 
 
 		 860 aa  67.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  38.1 
 
 		 770 aa  68.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  39.69 
 
 		 889 aa  67  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  37.3 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  28.42 
 
 		 777 aa  66.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1879 aa  66.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  38.68 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  33.88 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  24.24 
 
 		 5559 aa  61.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  45.83 
 
 		 2768 aa  61.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  24.29 
 
 		 5561 aa  61.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  24.1 
 
 		 4661 aa  60.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  31.71 
 
 		 763 aa  60.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  24.34 
 
 		 5559 aa  60.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.25 
 
 		 3563 aa  60.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.66 
 
 		 11716 aa  59.7  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  38.26 
 
 		 954 aa  59.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  37.4 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  23.38 
 
 		 2853 aa  58.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  24.43 
 
 		 5561 aa  58.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  26.75 
 
 		 1222 aa  57.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  28.1 
 
 		 2886 aa  57.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  43.36 
 
 		 5442 aa  57.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  40 
 
 		 479 aa  56.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  26.76 
 
 		 683 aa  55.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.61 
 
 		 4285 aa  55.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  36.43 
 
 		 756 aa  53.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  23.48 
 
 		 3598 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  24.51 
 
 		 5561 aa  54.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  27.89 
 
 		 2636 aa  53.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  43.01 
 
 		 3340 aa  52.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.37 
 
 		 680 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  37.5 
 
 		 764 aa  51.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.71 
 
 		 4689 aa  50.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.85 
 
 		 5216 aa  50.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.99 
 
 		 16311 aa  49.7  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.44 
 
 		 2507 aa  49.7  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.56 
 
 		 3552 aa  49.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  35.23 
 
 		 570 aa  48.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  31.97 
 
 		 1641 aa  48.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.93 
 
 		 1372 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  26.03 
 
 		 6678 aa  48.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  40.35 
 
 		 2839 aa  47.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  29.41 
 
 		 3911 aa  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.64 
 
 		 4761 aa  47.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1551  hypothetical protein  29.55 
 
 		 872 aa  46.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  27.47 
 
 		 4687 aa  46.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1727 aa  45.8  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>