114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2189 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  96.92 
 
 		 520 aa  1022    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  100 
 
 		 520 aa  1046    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  24 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  24.16 
 
 		 522 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  22.54 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  25.7 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  24.44 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  20.95 
 
 		 536 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  20.08 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  21.8 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  23.12 
 
 		 545 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  52.27 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  25.81 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 		 620 aa  53.9  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  54.17 
 
 		 184 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  48.08 
 
 		 604 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 175 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  46.15 
 
 		 631 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  48.08 
 
 		 613 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  42.11 
 
 		 216 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 302 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 289 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  42.22 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  46.15 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  46.15 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  46.15 
 
 		 621 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  45.65 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  46.15 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  53.85 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.19 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 		 368 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 1225 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  46.67 
 
 		 372 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  46.67 
 
 		 372 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  44.23 
 
 		 721 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 		 754 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 447 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  48.94 
 
 		 608 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  42.19 
 
 		 560 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 142 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  47.92 
 
 		 1556 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  36.96 
 
 		 499 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  36.67 
 
 		 284 aa  47  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  26.09 
 
 		 612 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.09 
 
 		 612 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.38 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  53.49 
 
 		 179 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 1021 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  40 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  40.82 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  42.55 
 
 		 200 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  44.23 
 
 		 674 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  44 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  41.67 
 
 		 194 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  43.48 
 
 		 235 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  40.43 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  40.43 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1083  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.73 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.91418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  40.43 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4659  lysm domain-containing protein  46.81 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00627115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  40 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.18 
 
 		 192 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  38.3 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.86 
 
 		 554 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  32.84 
 
 		 751 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  40.43 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.61 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  28.95 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.66 
 
 		 1001 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  44.19 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  47.5 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  36.73 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 207 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.48 
 
 		 75 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  42 
 
 		 205 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  38.3 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  38.3 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42 
 
 		 335 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 173 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  42.31 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 285 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  38.3 
 
 		 265 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  48.94 
 
 		 310 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  23.75 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>