51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0053 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  71.13 
 
 		 481 aa  661    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 545 aa  1065    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  31.24 
 
 		 536 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  30.12 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 		 530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.83 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  25.18 
 
 		 522 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  21.96 
 
 		 522 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  25.59 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  18.74 
 
 		 523 aa  96.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  46.25 
 
 		 179 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  21.02 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  22.91 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  19.73 
 
 		 511 aa  67  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  24.28 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  23.12 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3521  Peptidoglycan-binding LysM  56.82 
 
 		 185 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000216778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.06 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2271  hypothetical protein  36 
 
 		 173 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 159 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  48.08 
 
 		 156 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  41.89 
 
 		 301 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  46.43 
 
 		 112 aa  53.5  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 168 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  47.73 
 
 		 332 aa  50.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  48.08 
 
 		 128 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  46.94 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.74 
 
 		 192 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  51.16 
 
 		 221 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 173 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  43.18 
 
 		 423 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  35.56 
 
 		 442 aa  47.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 341 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  46.43 
 
 		 109 aa  47  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1086  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 163 aa  47  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.463128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2272  hypothetical protein  32.95 
 
 		 174 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  41.27 
 
 		 912 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.89 
 
 		 335 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 583 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  40.48 
 
 		 331 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  33.78 
 
 		 286 aa  44.3  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  48.84 
 
 		 445 aa  44.3  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 130 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  41.67 
 
 		 420 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 191 aa  43.9  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  41.27 
 
 		 911 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  30.99 
 
 		 698 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 445 aa  43.5  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  41.27 
 
 		 911 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>