41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2402 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 522 aa  1055    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  44.62 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  27.9 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  24.28 
 
 		 523 aa  207  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  26.1 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  25.79 
 
 		 530 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  23.8 
 
 		 520 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  24 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  25.46 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  23.44 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  24.8 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  23.11 
 
 		 481 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  21.06 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  20.79 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  21.34 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.27 
 
 		 192 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  32.65 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  40.98 
 
 		 546 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 330 aa  47.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  34.21 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  31.31 
 
 		 255 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  43.59 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  34.85 
 
 		 301 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.64 
 
 		 274 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  35.56 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  35.56 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 		 168 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  45.1 
 
 		 310 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 430 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  29.35 
 
 		 219 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4305  sporulation stage VI protein D  38.46 
 
 		 325 aa  43.5  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  36.92 
 
 		 487 aa  43.5  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>