More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3016 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  69.12 
 
 		 578 aa  791    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 577 aa  1161    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  90.53 
 
 		 574 aa  1008    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  42.35 
 
 		 1827 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 		 523 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  41.08 
 
 		 740 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 608 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 747 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 		 1450 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  39.33 
 
 		 648 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 		 688 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 		 747 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 620 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 1038 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.43 
 
 		 620 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 542 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 3145 aa  313  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 		 615 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 955 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.57 
 
 		 714 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.41 
 
 		 703 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 714 aa  296  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 		 438 aa  293  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.89 
 
 		 556 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  42.18 
 
 		 529 aa  293  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.25 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 		 767 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.34 
 
 		 760 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 935 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.57 
 
 		 689 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.02 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 639 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 615 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 1005 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 		 646 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 612 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 649 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 649 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  38.42 
 
 		 540 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  40.8 
 
 		 473 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.43 
 
 		 1034 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 636 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 662 aa  276  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 681 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.84 
 
 		 626 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 637 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 637 aa  273  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 		 484 aa  272  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  40.48 
 
 		 636 aa  270  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  37.09 
 
 		 1764 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 472 aa  267  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 635 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 635 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 520 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  35.58 
 
 		 1077 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 		 780 aa  261  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 614 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 614 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.57 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.08 
 
 		 1677 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 626 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 527 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.54 
 
 		 603 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  33.39 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  40.86 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 		 412 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 583 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 1212 aa  236  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 571 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.03 
 
 		 550 aa  231  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 1451 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 1454 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 546 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 559 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 		 593 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.65 
 
 		 872 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 595 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.78 
 
 		 600 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 607 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  39.77 
 
 		 389 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  39.7 
 
 		 360 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  35.52 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>