More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0190 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  84.5 
 
 		 602 aa  1042    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 601 aa  1211    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  40.03 
 
 		 592 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 620 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 615 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.2 
 
 		 608 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.4 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  40 
 
 		 626 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 688 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  41.17 
 
 		 1450 aa  346  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  39.68 
 
 		 626 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 		 614 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  39.2 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  39.2 
 
 		 614 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  39.2 
 
 		 614 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  39.2 
 
 		 614 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 3145 aa  334  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 614 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.35 
 
 		 689 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  38.9 
 
 		 556 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 578 aa  317  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  35.07 
 
 		 630 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.01 
 
 		 604 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 		 636 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 639 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 612 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  41.4 
 
 		 1005 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1827 aa  307  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.18 
 
 		 714 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.62 
 
 		 1034 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 955 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 1038 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 681 aa  300  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 607 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 		 611 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  41.44 
 
 		 703 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 635 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 635 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  41.03 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  35.88 
 
 		 648 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 740 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 767 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  35.6 
 
 		 662 aa  287  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  34.54 
 
 		 615 aa  283  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  39.78 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 637 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.15 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 935 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.48 
 
 		 653 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 653 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.26 
 
 		 603 aa  278  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.88 
 
 		 1077 aa  277  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 523 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 		 649 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 		 649 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 		 646 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.5 
 
 		 760 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 780 aa  263  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 747 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  36.27 
 
 		 1764 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 747 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 636 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1451 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 611 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1454 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.72 
 
 		 1677 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.9 
 
 		 550 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  33.45 
 
 		 540 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 527 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 438 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 536 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 412 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.06 
 
 		 872 aa  230  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  40.5 
 
 		 387 aa  230  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.47 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 559 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  35.26 
 
 		 546 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  37.44 
 
 		 593 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  39.82 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.1 
 
 		 503 aa  224  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 505 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.18 
 
 		 600 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 		 571 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  37.2 
 
 		 545 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>