More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1587 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 801 aa  1609    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  88.07 
 
 		 803 aa  1304    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  37.96 
 
 		 773 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  40.47 
 
 		 780 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  39.94 
 
 		 751 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  38.12 
 
 		 774 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.99 
 
 		 819 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  29.6 
 
 		 829 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  29.75 
 
 		 745 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  30.04 
 
 		 763 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  28.26 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  45.45 
 
 		 779 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  29.51 
 
 		 772 aa  253  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  28.06 
 
 		 681 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  44.93 
 
 		 784 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  28.19 
 
 		 775 aa  250  9e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  27.8 
 
 		 775 aa  248  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  40.89 
 
 		 805 aa  228  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  37.82 
 
 		 767 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  36.59 
 
 		 797 aa  200  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  34.88 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  28.09 
 
 		 686 aa  177  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  27.47 
 
 		 789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  36.16 
 
 		 776 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  35.29 
 
 		 756 aa  165  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  32.95 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  25.43 
 
 		 728 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  26.6 
 
 		 717 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  27.09 
 
 		 781 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  27.09 
 
 		 781 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  30.15 
 
 		 766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  30.04 
 
 		 833 aa  140  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  24.56 
 
 		 752 aa  139  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  24.93 
 
 		 793 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  26.69 
 
 		 814 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  29.37 
 
 		 711 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  24.48 
 
 		 696 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 750 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.67 
 
 		 641 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  25.21 
 
 		 803 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  24.48 
 
 		 803 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  33.11 
 
 		 635 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  25.35 
 
 		 807 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  27.68 
 
 		 710 aa  128  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 733 aa  127  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  25.71 
 
 		 757 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  24.79 
 
 		 705 aa  126  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  23.49 
 
 		 803 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  25.42 
 
 		 783 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  29.68 
 
 		 696 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  26.98 
 
 		 799 aa  122  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.04 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  25.99 
 
 		 791 aa  122  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  25.6 
 
 		 703 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  30.18 
 
 		 660 aa  122  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  25.99 
 
 		 791 aa  121  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 704 aa  121  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  23.62 
 
 		 748 aa  121  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 706 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  28.32 
 
 		 697 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  27.08 
 
 		 724 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  26.69 
 
 		 710 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 716 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.48 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  32.13 
 
 		 630 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 704 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  26.08 
 
 		 747 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  22.81 
 
 		 681 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  29.58 
 
 		 702 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  27.3 
 
 		 738 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 740 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  26.51 
 
 		 902 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  26.25 
 
 		 702 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  30.5 
 
 		 703 aa  114  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 655 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  25.67 
 
 		 654 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  25.57 
 
 		 650 aa  114  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  26.33 
 
 		 705 aa  114  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  26.88 
 
 		 700 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  26.88 
 
 		 700 aa  114  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  25.57 
 
 		 654 aa  114  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  23.23 
 
 		 892 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  30.29 
 
 		 640 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  28.97 
 
 		 733 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  26.11 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  25.83 
 
 		 897 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  29.1 
 
 		 774 aa  112  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  26.81 
 
 		 707 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.38 
 
 		 787 aa  111  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  27.13 
 
 		 714 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  29.32 
 
 		 640 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  26.07 
 
 		 810 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  29.26 
 
 		 744 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  28.71 
 
 		 771 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>