More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3340 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  56.38 
 
 
732 aa  737    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
828 aa  1680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  52.43 
 
 
824 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  61.9 
 
 
833 aa  953    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  51.95 
 
 
789 aa  788    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  76.67 
 
 
828 aa  1313    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  61.54 
 
 
833 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  76.67 
 
 
828 aa  1309    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  50.52 
 
 
598 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  52.6 
 
 
595 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  50.87 
 
 
619 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  49.56 
 
 
626 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  44.73 
 
 
754 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  44.43 
 
 
754 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 
708 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
789 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
909 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.22 
 
 
589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 
718 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.91 
 
 
816 aa  333  8e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
1714 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.37 
 
 
589 aa  324  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
3035 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.29 
 
 
1106 aa  318  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
4489 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
1106 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
808 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.94 
 
 
1221 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
796 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
1094 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.33 
 
 
739 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  38.82 
 
 
585 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.98 
 
 
596 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
717 aa  300  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
717 aa  300  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.4 
 
 
708 aa  300  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  34.59 
 
 
797 aa  298  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.81 
 
 
699 aa  297  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.96 
 
 
937 aa  292  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
968 aa  291  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
713 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.86 
 
 
1415 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.79 
 
 
739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.8 
 
 
667 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
776 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
776 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
776 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 
821 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  33.75 
 
 
821 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
776 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
776 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
633 aa  282  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  31.31 
 
 
780 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
780 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
727 aa  280  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  28.25 
 
 
790 aa  280  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.5 
 
 
790 aa  280  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
733 aa  276  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 
781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
750 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.36 
 
 
740 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 
723 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 
529 aa  271  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  35.3 
 
 
627 aa  270  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.82 
 
 
739 aa  270  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
1085 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
822 aa  267  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
779 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
3560 aa  260  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
734 aa  259  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
693 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.64 
 
 
742 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 
700 aa  254  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.71 
 
 
715 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
1143 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.84 
 
 
1144 aa  242  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.56 
 
 
793 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 
633 aa  239  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
761 aa  238  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  33.55 
 
 
921 aa  238  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
706 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 
974 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
1116 aa  231  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
739 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
647 aa  230  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  34.73 
 
 
552 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
667 aa  229  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
750 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.73 
 
 
810 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
632 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 
878 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 
1154 aa  210  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  28.7 
 
 
680 aa  207  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
647 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
574 aa  201  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 
740 aa  201  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
732 aa  200  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  27.48 
 
 
553 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
724 aa  199  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  32.44 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>