More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 752 aa  1509    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  48.9 
 
 		 733 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  42.17 
 
 		 711 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  27.62 
 
 		 681 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  26.61 
 
 		 696 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 686 aa  190  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  28.68 
 
 		 745 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 780 aa  180  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  27.26 
 
 		 767 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  24.67 
 
 		 829 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  25.74 
 
 		 751 aa  169  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  35.37 
 
 		 779 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  34.38 
 
 		 784 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  26.02 
 
 		 773 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  26.97 
 
 		 720 aa  161  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  24.53 
 
 		 763 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  27.08 
 
 		 728 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  26.68 
 
 		 793 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  25.39 
 
 		 774 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  33.45 
 
 		 756 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.35 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  25.81 
 
 		 736 aa  150  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  24.71 
 
 		 775 aa  150  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  31.08 
 
 		 797 aa  150  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  24.1 
 
 		 803 aa  150  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  25.97 
 
 		 738 aa  150  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  31.1 
 
 		 794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  24.56 
 
 		 775 aa  148  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  25.04 
 
 		 772 aa  149  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  31.37 
 
 		 805 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.41 
 
 		 799 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.46 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.88 
 
 		 717 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  26.02 
 
 		 733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  24.02 
 
 		 783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  24.91 
 
 		 783 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  31.25 
 
 		 801 aa  139  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  25.96 
 
 		 650 aa  138  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  25.96 
 
 		 654 aa  138  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  25.81 
 
 		 654 aa  138  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  31.53 
 
 		 833 aa  138  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  23.65 
 
 		 740 aa  137  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  31.43 
 
 		 751 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  23.94 
 
 		 753 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  22.21 
 
 		 781 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.48 
 
 		 804 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  25.57 
 
 		 689 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  24.39 
 
 		 686 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  21.9 
 
 		 781 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  24.54 
 
 		 686 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  24.54 
 
 		 686 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  24.54 
 
 		 686 aa  132  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  24.54 
 
 		 686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  28.43 
 
 		 810 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  26.52 
 
 		 787 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  24.41 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  30.55 
 
 		 775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.87 
 
 		 776 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  25.26 
 
 		 789 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  24.89 
 
 		 655 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  23.79 
 
 		 757 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  23.79 
 
 		 757 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  23.79 
 
 		 757 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  23.79 
 
 		 757 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  25.09 
 
 		 803 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  29.03 
 
 		 766 aa  127  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  24.08 
 
 		 807 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  23.64 
 
 		 750 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  27.67 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  23.64 
 
 		 757 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  28.99 
 
 		 777 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  28.99 
 
 		 771 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  24.59 
 
 		 803 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.08 
 
 		 750 aa  125  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  23.1 
 
 		 702 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  23.18 
 
 		 757 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  28.8 
 
 		 781 aa  124  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  23.51 
 
 		 744 aa  124  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  25.34 
 
 		 681 aa  124  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  28.7 
 
 		 803 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  28.23 
 
 		 584 aa  121  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 780 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  28.39 
 
 		 774 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  28.39 
 
 		 774 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  30.07 
 
 		 793 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  27.98 
 
 		 641 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  29.5 
 
 		 696 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  29.9 
 
 		 584 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  29.29 
 
 		 716 aa  118  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  22.47 
 
 		 670 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  24.3 
 
 		 640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 		 480 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  30.12 
 
 		 774 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  23.69 
 
 		 662 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  29.67 
 
 		 734 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  28.94 
 
 		 1421 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  23.69 
 
 		 672 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  28.34 
 
 		 787 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  24.12 
 
 		 660 aa  114  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>