More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2060 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  67.31 
 
 		 1077 aa  732    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 1206 aa  2348    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  66.32 
 
 		 1021 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  67.84 
 
 		 1078 aa  745    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  36.65 
 
 		 956 aa  317  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  33.33 
 
 		 976 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  29.35 
 
 		 918 aa  245  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.9 
 
 		 970 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  29.73 
 
 		 901 aa  198  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  33.22 
 
 		 881 aa  195  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  30.11 
 
 		 947 aa  121  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  25.23 
 
 		 977 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  27.02 
 
 		 982 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.06 
 
 		 830 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  56.86 
 
 		 1394 aa  83.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  34.94 
 
 		 421 aa  81.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  37.22 
 
 		 970 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  21.09 
 
 		 979 aa  79.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  34.48 
 
 		 442 aa  77  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.92 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  38.79 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.38 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.36 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.57 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  37.38 
 
 		 1005 aa  74.7  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.43 
 
 		 1078 aa  74.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.65 
 
 		 446 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  36.04 
 
 		 451 aa  74.3  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  35.14 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  35.14 
 
 		 451 aa  74.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  31.06 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 450 aa  73.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 450 aa  73.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  35.37 
 
 		 439 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  33.15 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  30.67 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.1 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  28.57 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  35.14 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  35.76 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  37.07 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  30.54 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  37.93 
 
 		 444 aa  72  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.03 
 
 		 407 aa  72  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  38.17 
 
 		 428 aa  72  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.25 
 
 		 446 aa  72  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  33.62 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  37.07 
 
 		 449 aa  71.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.65 
 
 		 446 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.65 
 
 		 446 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.17 
 
 		 448 aa  70.1  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.83 
 
 		 432 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.52 
 
 		 427 aa  70.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  34.19 
 
 		 437 aa  70.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  37.07 
 
 		 449 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  31.1 
 
 		 442 aa  70.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.01 
 
 		 717 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  39.81 
 
 		 441 aa  70.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.03 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 436 aa  70.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  35.4 
 
 		 450 aa  70.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  34.19 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 442 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.55 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.45 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.82 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  39.6 
 
 		 1028 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  31.06 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  35.19 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  31.38 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.62 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.93 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  35.16 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.93 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  30.67 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  35.19 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  33.86 
 
 		 430 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.17 
 
 		 437 aa  67.4  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.73 
 
 		 421 aa  68.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 969 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.73 
 
 		 432 aa  67  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30 
 
 		 425 aa  67  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  34.19 
 
 		 461 aa  67.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.57 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 450 aa  66.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.14 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  35.48 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>