More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1546 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  100 
 
 
1147 aa  2310  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.25 
 
 
782 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.28 
 
 
1429 aa  137  1e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.72 
 
 
1441 aa  130  1e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
1313 aa  122  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
1060 aa  121  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.13 
 
 
1360 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.12 
 
 
1422 aa  117  9e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.83 
 
 
1238 aa  115  4e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  22.33 
 
 
992 aa  111  7e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1063 aa  111  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.58 
 
 
985 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.98 
 
 
1089 aa  110  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.26 
 
 
2145 aa  108  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
1101 aa  107  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 
828 aa  107  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.81 
 
 
1080 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.37 
 
 
957 aa  104  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  20.58 
 
 
1123 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.88 
 
 
991 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.36 
 
 
1550 aa  102  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  20.65 
 
 
1295 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  22.57 
 
 
967 aa  102  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  21.36 
 
 
1015 aa  102  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  22.46 
 
 
1826 aa  101  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 
1298 aa  100  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.55 
 
 
1180 aa  98.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.25 
 
 
609 aa  98.6  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
881 aa  94.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  25.36 
 
 
844 aa  94  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  21.04 
 
 
1005 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  26.51 
 
 
650 aa  92  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
1261 aa  91.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 
1266 aa  91.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  23.92 
 
 
755 aa  90.1  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.93 
 
 
1081 aa  89  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.71 
 
 
725 aa  89.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  19.67 
 
 
1271 aa  87.8  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.54 
 
 
1151 aa  87.4  1e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  19.64 
 
 
1153 aa  87.4  1e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.5 
 
 
1404 aa  87  2e-15  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 
775 aa  86.7  3e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.17 
 
 
852 aa  86.3  3e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  22.26 
 
 
954 aa  86.3  3e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  21.45 
 
 
1134 aa  86.3  3e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  22.54 
 
 
1151 aa  85.9  4e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
1526 aa  85.9  4e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.99 
 
 
1009 aa  85.5  6e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  21.94 
 
 
1020 aa  85.1  7e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.95 
 
 
1096 aa  84.7  8e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  24 
 
 
364 aa  84.7  9e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  19.12 
 
 
1093 aa  84.3  1e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
408 aa  84.3  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 
636 aa  83.6  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
3145 aa  83.2  2e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
973 aa  83.2  3e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
758 aa  82.4  4e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
412 aa  82.4  5e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  22.81 
 
 
872 aa  82  6e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  21.59 
 
 
1079 aa  82  6e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  24.04 
 
 
1029 aa  81.6  8e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.39 
 
 
1106 aa  81.3  9e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  21.65 
 
 
1148 aa  80.9  1e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  22.1 
 
 
966 aa  80.5  2e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
1025 aa  80.5  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  26.28 
 
 
919 aa  80.1  2e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  20.62 
 
 
1139 aa  80.1  3e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  21.62 
 
 
900 aa  79.7  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.97 
 
 
825 aa  79.3  3e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  24.39 
 
 
967 aa  79.3  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 
809 aa  79.7  3e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 
1186 aa  79.3  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  21.7 
 
 
991 aa  79  5e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  24.48 
 
 
993 aa  78.6  6e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.81 
 
 
1131 aa  78.6  6e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  20.38 
 
 
895 aa  78.6  7e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  22.92 
 
 
941 aa  78.6  7e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
760 aa  77.8  1e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  20.15 
 
 
1142 aa  77  2e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
949 aa  76.6  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  19.06 
 
 
1666 aa  76.3  3e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  24.83 
 
 
1611 aa  76.3  3e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  24.9 
 
 
900 aa  76.3  3e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
923 aa  76.3  4e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  24.92 
 
 
1121 aa  75.5  5e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  23.86 
 
 
357 aa  75.5  6e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  22.63 
 
 
1013 aa  75.5  6e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  24.29 
 
 
1109 aa  75.1  8e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1054 aa  74.3  1e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  24.16 
 
 
490 aa  73.6  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  26.55 
 
 
921 aa  73.6  2e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.02 
 
 
732 aa  73.2  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  21.93 
 
 
1054 aa  73.2  2e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.39 
 
 
1149 aa  73.2  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  21.07 
 
 
1123 aa  73.2  3e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  19.14 
 
 
1291 aa  73.2  3e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.89 
 
 
1175 aa  72.4  4e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  23.65 
 
 
718 aa  72.4  5e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
436 aa  72  5e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  21.31 
 
 
1153 aa  71.6  8e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>