More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0020 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0020  type IV secretion system protein PilT  100 
 
 		 318 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1511  type II secretion system protein E  38.26 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59340  type IV B pilus protein  41.73 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000971289  hitchhiker  0.00000000000867838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4477  Tfp pilus assembly protein ATPase PilU  42.19 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0066  type IV secretion system protein  36.56 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5246  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.337273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5445  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0323209  normal  0.0753929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5915  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  30.43 
 
 		 372 aa  85.9  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  28.88 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  27.85 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  28.15 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0118  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0334211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2719  type II secretion system protein E  27.57 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.616363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  29.07 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  29.28 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  28.04 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  29.73 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  30.05 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  26.46 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  26.94 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  28.95 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  26.82 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  26.85 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  26.94 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  24.76 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  26.94 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  25.69 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  28.95 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  28.06 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4160  twitching motility protein  25.44 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  29.41 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  29.41 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  25.66 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  28.77 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  22.15 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  26.36 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  22.15 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  25.38 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0461  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  32.06 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  33.79 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  26.2 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  29.51 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  26.55 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  24.54 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  27.05 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  25.47 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  27.1 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  25.47 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5143  twitching motility protein  25.32 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.847516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  33.12 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  26.2 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  28.74 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  28.65 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  28.74 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  26.61 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  27.23 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  25.76 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  25.41 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  26.6 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  25.45 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1842  ABC transporter  34.12 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  26.82 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  26.53 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  26.12 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  30.43 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  28.65 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  28.02 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  32.43 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  26.03 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  26.03 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  31.29 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  27.71 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  23.92 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  34.15 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  27.04 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  28.11 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  28.02 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  28.17 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  29.51 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  25.88 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  25.71 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  26.17 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  29.76 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  27.19 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  25.56 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  25.71 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  25.71 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  25.71 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  25.94 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  34.15 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  25.71 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  29.09 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  27.23 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>