More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0066 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0066  type IV secretion system protein  100 
 
 		 317 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59340  type IV B pilus protein  35.71 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000971289  hitchhiker  0.00000000000867838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1511  type II secretion system protein E  34.85 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4477  Tfp pilus assembly protein ATPase PilU  36.13 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0020  type IV secretion system protein PilT  36.56 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5246  type II secretion system protein E  35.86 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.337273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5445  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0323209  normal  0.0753929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  33.63 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  30.67 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  34.21 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  32.58 
 
 		 445 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  32.58 
 
 		 434 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  29.28 
 
 		 428 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5915  type II secretion system protein E  27.16 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  34.98 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  30.39 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  28.18 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  31.32 
 
 		 388 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  32.84 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  32.84 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  29.43 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  31.18 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  31.18 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  31.18 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  34.78 
 
 		 379 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  33.5 
 
 		 376 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  31.36 
 
 		 356 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  30.59 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  30.37 
 
 		 378 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  30.88 
 
 		 344 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  30.65 
 
 		 343 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  30.34 
 
 		 364 aa  92.4  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  31.37 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  36.31 
 
 		 401 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  28.13 
 
 		 385 aa  92.4  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  32.98 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  32.92 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  32.79 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  28.69 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  37.5 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  32.61 
 
 		 347 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  32.14 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  28.99 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  32.69 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  34.17 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  31.84 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  27.89 
 
 		 368 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  31.84 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  32.44 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  32.48 
 
 		 430 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  30.88 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  29.9 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  33.33 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  34.03 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  31.76 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  27.07 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  30.88 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  30.88 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  29.96 
 
 		 378 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  32.35 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  39.87 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  32.97 
 
 		 375 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  29.53 
 
 		 363 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  28.46 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  29.9 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  34.76 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  29.54 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  29.04 
 
 		 423 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  33.77 
 
 		 343 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 546 aa  89  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  29.41 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  27.39 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  33.77 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  30.7 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  34.44 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  33.77 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  31.19 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  31.98 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  28.4 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  39.87 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  29.5 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  30.43 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  27.59 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  29.84 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  29.54 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  32.26 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  30.93 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  31.46 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2719  type II secretion system protein E  25.55 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.616363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  30.93 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  32.61 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  33.15 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  32.98 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  29.61 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  30.04 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  30.63 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  29.92 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  30.81 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  34.78 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>