More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0409 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  100 
 
 		 370 aa  753    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  53.31 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  51.31 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  53.07 
 
 		 351 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  50 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  50.29 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  52.1 
 
 		 351 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  50.72 
 
 		 368 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  49.73 
 
 		 365 aa  341  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  49.3 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  49.3 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  51.67 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  49.71 
 
 		 370 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.15 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  49.39 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  46.61 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  48.71 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  52 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  50.29 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  51.09 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  49.71 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.72 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  51.22 
 
 		 345 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.74 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.86 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.88 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50.3 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  46.4 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  47.44 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  51.04 
 
 		 339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  48.01 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  48.52 
 
 		 345 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  46.69 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.56 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  46.88 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.27 
 
 		 344 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.08 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  48.7 
 
 		 365 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  48.27 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  49.7 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  45.75 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  47.67 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  47.94 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  46.96 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  47.54 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  46.89 
 
 		 374 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.6 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  48.38 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  47.56 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.82 
 
 		 347 aa  322  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.66 
 
 		 347 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  50.15 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  47.28 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  50.31 
 
 		 360 aa  322  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.49 
 
 		 345 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.49 
 
 		 345 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  49.54 
 
 		 347 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  48.18 
 
 		 356 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  49.39 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  48.09 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.49 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.99 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.06 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  50.61 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.06 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  47.06 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.97 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.06 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  47.4 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  48.17 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  49.21 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  48.17 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  50.15 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  49.25 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.63 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.65 
 
 		 345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  47.92 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  49.24 
 
 		 358 aa  319  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.06 
 
 		 349 aa  318  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  49.55 
 
 		 344 aa  318  9e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.86 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  46.9 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.45 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  46.76 
 
 		 345 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  48.16 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  49.54 
 
 		 347 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  49.56 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  49.85 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  49.24 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  49.24 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  47.21 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.68 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  46.04 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  45.68 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  46.04 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  47.21 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  45.3 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  46.22 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  46.63 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>