More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5872 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  100 
 
 		 366 aa  750    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  100 
 
 		 366 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  69.3 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  69.3 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  70.22 
 
 		 367 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  69.62 
 
 		 343 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  69.91 
 
 		 343 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  69.3 
 
 		 368 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  69.3 
 
 		 368 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  69.62 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  45.86 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  45.81 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  44.32 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  35.48 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  38.25 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  35.19 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  43.08 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  38.92 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  41.2 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  38.08 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.37 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  36.42 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  41.6 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  39.93 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  37.1 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  35.73 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  38.6 
 
 		 358 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  33.53 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  40.83 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  38.75 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  39.04 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  35.22 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  37.82 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  36.19 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  44.87 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  40 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  38.46 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  42.8 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  38.85 
 
 		 372 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  38.85 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  42.8 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  38.77 
 
 		 414 aa  193  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  38.14 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  44.89 
 
 		 377 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  40.7 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  47.77 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  39.71 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  39.78 
 
 		 566 aa  192  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  36.42 
 
 		 434 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  36.42 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  36.69 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  35.67 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  36.69 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  34.02 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  38.65 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  37.86 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  38.38 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  37.05 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  38.54 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  40.23 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  47.06 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  40.36 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  40.79 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  44.95 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  44.95 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  42.61 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  38.68 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  40.55 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  37.5 
 
 		 364 aa  189  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  39.22 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  40.88 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  38.63 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  36.75 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  32.86 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0165  twitching motility protein  44.4 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.753648  normal  0.198553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  39.65 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  39.15 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  39.65 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  39.65 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  39.78 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  36.73 
 
 		 366 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  40.78 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  39.04 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  38.85 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  41.6 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  37.64 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  41.9 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  44.75 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  33.04 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  40 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  37.18 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  36.71 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  35.99 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  39.37 
 
 		 360 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  47.15 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  34.78 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  36.88 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  38.7 
 
 		 374 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  41.85 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>