More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3586 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  100 
 
 
377 aa  773    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  52.59 
 
 
403 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.32 
 
 
368 aa  343  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50.28 
 
 
370 aa  339  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  46.74 
 
 
351 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  47.97 
 
 
360 aa  316  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  46.85 
 
 
351 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.23 
 
 
349 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  44.02 
 
 
358 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  44.99 
 
 
372 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.43 
 
 
365 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  48.78 
 
 
367 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  45.26 
 
 
374 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  46.07 
 
 
347 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  48.29 
 
 
351 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  48.4 
 
 
339 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  43.99 
 
 
360 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  44.72 
 
 
374 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  43.96 
 
 
363 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  43.41 
 
 
360 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  42.66 
 
 
357 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  44.92 
 
 
372 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  44.99 
 
 
358 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  45.63 
 
 
397 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  44.09 
 
 
362 aa  290  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  45.68 
 
 
347 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  45 
 
 
347 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  44.75 
 
 
566 aa  290  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  43.94 
 
 
360 aa  289  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  46.57 
 
 
352 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  45.28 
 
 
347 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.51 
 
 
347 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  45.56 
 
 
347 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  45.56 
 
 
347 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  45.56 
 
 
347 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  42.78 
 
 
351 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  44.93 
 
 
365 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  44.78 
 
 
347 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.6 
 
 
347 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  43.09 
 
 
366 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  45.51 
 
 
347 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  42.82 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  44.81 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  43.63 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  43.16 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  44.26 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  45.05 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  45.83 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  49.48 
 
 
363 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  45.05 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  43.25 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  45.3 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  43.53 
 
 
383 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.68 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  45.56 
 
 
347 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  44.78 
 
 
366 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  45.26 
 
 
437 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  44.94 
 
 
347 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.87 
 
 
382 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  43.51 
 
 
365 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  44.04 
 
 
370 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  43.82 
 
 
347 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  44.72 
 
 
347 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  45.68 
 
 
347 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  42.93 
 
 
362 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  44.57 
 
 
344 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  44.54 
 
 
430 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  42.66 
 
 
372 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  42.93 
 
 
372 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  44.88 
 
 
346 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  42.98 
 
 
347 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  42.39 
 
 
372 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  42.35 
 
 
387 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  43.68 
 
 
386 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  44.9 
 
 
427 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  44.9 
 
 
427 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.19 
 
 
374 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  42.31 
 
 
365 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  45.13 
 
 
347 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  44.63 
 
 
427 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  45.69 
 
 
345 aa  276  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  44.07 
 
 
350 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  43.53 
 
 
383 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  41.89 
 
 
370 aa  275  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  44.35 
 
 
350 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  44.94 
 
 
345 aa  275  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  44.73 
 
 
347 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  42.7 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  44.63 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  44.73 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  44.41 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  41.87 
 
 
387 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  43.05 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.94 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  45.38 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  44.66 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  43.61 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  45.53 
 
 
344 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  44.29 
 
 
344 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  44.94 
 
 
345 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>