More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5907 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5907  type II secretion system protein E  100 
 
 
367 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  0.0582913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  70.22 
 
 
366 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  70.22 
 
 
366 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0656  putative twitching motility protein PilT  64.27 
 
 
368 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1977  putative twitching motility protein PilT  64.27 
 
 
368 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00646916  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1612  putative twitching motility protein PilT  66.08 
 
 
343 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0768  twitching motility protein PilT, putative  65.78 
 
 
343 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2176  twitching motility protein PilT  64.27 
 
 
368 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0636197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2259  twitching motility protein PilT  64.27 
 
 
368 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0658  twitching motility protein  66.08 
 
 
343 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5443  type II secretion system protein E  43.58 
 
 
369 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00200172  normal  0.203464 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5248  type II secretion system protein E  44.21 
 
 
368 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233456  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  35.73 
 
 
362 aa  193  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  35.01 
 
 
375 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  39.35 
 
 
355 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  36.86 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  34.1 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  36.95 
 
 
356 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  32.88 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  38.81 
 
 
430 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  37.98 
 
 
566 aa  186  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  33.05 
 
 
366 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  37.86 
 
 
396 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  32.71 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  38.1 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  39.86 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  34.33 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  40.14 
 
 
344 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  34.27 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  32.16 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  33.43 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  35.17 
 
 
351 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  33.43 
 
 
344 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  34.05 
 
 
365 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  43.83 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  33.92 
 
 
365 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  36.68 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  35.63 
 
 
388 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  38.41 
 
 
357 aa  182  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  37.06 
 
 
349 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3586  twitching motility protein  38.63 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  33.04 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  36.9 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  38.93 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  34.13 
 
 
386 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  33.92 
 
 
366 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  38.6 
 
 
361 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  39.16 
 
 
347 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  34.55 
 
 
368 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  33.92 
 
 
366 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  34.11 
 
 
347 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  35.17 
 
 
347 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  38.57 
 
 
383 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  35.63 
 
 
349 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  33.92 
 
 
366 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  33.82 
 
 
378 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  35.51 
 
 
358 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  33.92 
 
 
365 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  35.42 
 
 
345 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  39.03 
 
 
347 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0814  twitching motility protein  39.26 
 
 
361 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  37.5 
 
 
437 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  37.55 
 
 
387 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  36.86 
 
 
352 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  35.44 
 
 
362 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  45.45 
 
 
382 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  35.83 
 
 
356 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  36.68 
 
 
363 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  37.79 
 
 
374 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  34.11 
 
 
347 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  38.66 
 
 
427 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  38.36 
 
 
358 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  38.32 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  35.64 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  33.9 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  32.66 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  35.67 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  36.39 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  33.85 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  34.88 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  36.01 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  33.73 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  36.92 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  34.77 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  33.33 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  36.92 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  40.4 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  36.92 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  37.7 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  33.43 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  40.95 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  38.01 
 
 
347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0165  twitching motility protein  41.81 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.753648  normal  0.198553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  37.5 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  43.54 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  37.85 
 
 
347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  37.5 
 
 
347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  35.74 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  43.54 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  37.55 
 
 
427 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>