More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1421 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1467  twitching motility protein  98.06 
 
 
360 aa  724    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1421  twitching motility protein  100 
 
 
360 aa  737    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  62.46 
 
 
355 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  61.36 
 
 
352 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  53.28 
 
 
360 aa  362  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  50.99 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  50.28 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  50.47 
 
 
339 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  46.69 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  48.27 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  46.99 
 
 
363 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  50 
 
 
351 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  49.3 
 
 
365 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  47.7 
 
 
349 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  47.14 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  46.44 
 
 
362 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  46.13 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50 
 
 
360 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  47.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  46.2 
 
 
351 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  48.39 
 
 
374 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  47.99 
 
 
358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  46.02 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  50 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  48.5 
 
 
367 aa  309  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  46.5 
 
 
361 aa  310  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  47.71 
 
 
365 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  47.49 
 
 
351 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  49.71 
 
 
366 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.87 
 
 
360 aa  308  8e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  49.71 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  46.24 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.41 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.13 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  49.55 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  48.8 
 
 
368 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  46.09 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  46.09 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  46.03 
 
 
362 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  47.09 
 
 
374 aa  305  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  45.27 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  46 
 
 
360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  45.33 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  48.74 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.35 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  47.65 
 
 
352 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  49.06 
 
 
370 aa  301  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  46.36 
 
 
349 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.13 
 
 
347 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  45.82 
 
 
372 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  46.36 
 
 
349 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.21 
 
 
350 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  48.1 
 
 
368 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  47.92 
 
 
350 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  47.11 
 
 
344 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  47.11 
 
 
344 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  47.16 
 
 
350 aa  299  6e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  46.83 
 
 
345 aa  298  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1747  twitching motility protein  46.63 
 
 
370 aa  298  8e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555642  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  46.71 
 
 
347 aa  298  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  46.85 
 
 
347 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  47.73 
 
 
345 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  44.97 
 
 
566 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  47.88 
 
 
345 aa  298  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  45 
 
 
356 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  45.56 
 
 
375 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  48.76 
 
 
346 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1359  twitching mobility protein  45.4 
 
 
371 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00791421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  45.99 
 
 
358 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1171  twitching motility protein  44.51 
 
 
371 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000567965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  47.13 
 
 
345 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  46.97 
 
 
345 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  46.83 
 
 
345 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  46.83 
 
 
345 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  46.76 
 
 
373 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  46.83 
 
 
345 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.13 
 
 
345 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  46.18 
 
 
358 aa  296  5e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  47.34 
 
 
372 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  47.34 
 
 
372 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  46.35 
 
 
372 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.13 
 
 
345 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.13 
 
 
345 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  47.21 
 
 
350 aa  296  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.92 
 
 
347 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.13 
 
 
345 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  48.32 
 
 
344 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  48.22 
 
 
366 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  44.38 
 
 
374 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  46.67 
 
 
345 aa  295  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  46.2 
 
 
349 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  44.05 
 
 
358 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  44.87 
 
 
356 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  48.45 
 
 
346 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  47.13 
 
 
345 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  48.5 
 
 
344 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  46.53 
 
 
349 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  45.9 
 
 
347 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  46.97 
 
 
344 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  46.71 
 
 
403 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>