More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0739 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  100 
 
 		 321 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  29.34 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  31.61 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  26.6 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  26.62 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  26.37 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  26.37 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  26.37 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  26.37 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  27.76 
 
 		 449 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  27.72 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  26.67 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  25.42 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  25.42 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  25.42 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  25.42 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  26.32 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  26.32 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  26.32 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  30.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  30.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  30.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  30.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  30.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  30.93 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  25.6 
 
 		 621 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  29.81 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  24.92 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  25 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  26.46 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  26.85 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  24.13 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.15 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  23.81 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  22.67 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  25.35 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  24 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.44 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  23 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  21.78 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.73 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  24.49 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  23.74 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.45 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  26.12 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  21.66 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  23.03 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  27.95 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  24.4 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  29.09 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  31.25 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  22.84 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  23.67 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.71 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  24.5 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  23.58 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  24.5 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.58 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.81 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  22.15 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.7 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  27.27 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  22.52 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  23.93 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  23.93 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  23.93 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  23.93 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  25.54 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  24.23 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.89 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  23.46 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  25.13 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  21 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  23.37 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  23.04 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  21.6 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.59 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  22.73 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.26 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  22.46 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  21.69 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  22.01 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>