More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7621 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  95.69 
 
 		 325 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  100 
 
 		 325 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  36.42 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  33.87 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  37.04 
 
 		 449 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  30.54 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  30.54 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  30.54 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  30.54 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  30.53 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  31.73 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  31.73 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  30.57 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  31.41 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  29.45 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  30.22 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  30.37 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  38.29 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.91 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  41.86 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  29.74 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  29.74 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  29.74 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  27.58 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  28.25 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  30.24 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  28.8 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  32.24 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  25.08 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  25.8 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  28.21 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  28.21 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  27.16 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  23.81 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  26.84 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  26.84 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  26.84 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  31.01 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  28.95 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.17 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.72 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.72 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  28.95 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.17 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  28.42 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.17 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  30.96 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  29.81 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  28.42 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.91 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.37 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  28.95 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30.4 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  31.09 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.9 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.75 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  27.8 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  22.92 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27.83 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  31.88 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.3 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.26 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  31.41 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  26.18 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  26.12 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  32.08 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  27.27 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.52 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  30.27 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  31.8 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>