267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0422 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  100 
 
 		 316 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  46.78 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  42.27 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  45.36 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  44.22 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  41.95 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  41.72 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  39.74 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  40.91 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  38.91 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  38.39 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  36.39 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  36.39 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  36.48 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  42.26 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  36.39 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  34.42 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  34.42 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  34.42 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  34.42 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  36.42 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  36.42 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  34.39 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  31.33 
 
 		 449 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  32.52 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  40.1 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  30.89 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  31.91 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  31.91 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  31.91 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  31.91 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  31.91 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  31.91 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  30.57 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  38.46 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  30.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  30.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  30.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  30.43 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  28.33 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  29.91 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  24.09 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  25.87 
 
 		 621 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  24.13 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2640  hypothetical protein  44.79 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00286282  hitchhiker  0.00560989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  29.1 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  24.84 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  25 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.27 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.2 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  30.06 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.61 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  33.79 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31.63 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  30.9 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  27.13 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  25.5 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.9 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  25.5 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  31.06 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  27.2 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.57 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  25.93 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.44 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  24.74 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  30.7 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  25.7 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.94 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  25.1 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  30.7 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  33.82 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0993  integrase family protein  24.65 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00576914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  30.91 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  23.76 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  28.41 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  31.15 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.5 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1217  integrase family protein  29.56 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0758946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  28.73 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.55 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>