44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2215 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1301    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  28.08 
 
 		 321 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  26.32 
 
 		 324 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  26.96 
 
 		 321 aa  107  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  26.96 
 
 		 321 aa  107  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  26.96 
 
 		 321 aa  107  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  26.96 
 
 		 321 aa  107  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  28.13 
 
 		 323 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  26.28 
 
 		 325 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  25.6 
 
 		 321 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  25.87 
 
 		 316 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  25 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  23.1 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  22.4 
 
 		 322 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  25.16 
 
 		 449 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  22.04 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  24.15 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  23.08 
 
 		 315 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  22.07 
 
 		 313 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  22.07 
 
 		 313 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  22.07 
 
 		 313 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  23.15 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  22.26 
 
 		 313 aa  53.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  23.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  23.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  23.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  23.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  23.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  23.15 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 310 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  26.56 
 
 		 309 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 307 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  21.48 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  21.48 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  21.48 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  21.48 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  20.98 
 
 		 310 aa  47.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  19.93 
 
 		 318 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 376 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 376 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  23.65 
 
 		 376 aa  43.9  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.2 
 
 		 312 aa  43.9  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  22.88 
 
 		 309 aa  43.5  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>