More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0371 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  100 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  56.21 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  43.83 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  46.78 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  43.73 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  42.47 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  41.86 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  41.91 
 
 		 313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  44.01 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  41.85 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  41.69 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  39.07 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  39.07 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  39.07 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  39.6 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  38.28 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  38.67 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  38.67 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  39.02 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  38.31 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.93 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  38.13 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  38.13 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  38.13 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  38.13 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  33.98 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  34 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  34.71 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  37.8 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  33.55 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  32.11 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  32.11 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  32.11 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  32.11 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  32.11 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  32.11 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  30.53 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  29.91 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  29.97 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  29.97 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  29.97 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  29.97 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  34.49 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  26.67 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  24.91 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  24.58 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2640  hypothetical protein  45.79 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00286282  hitchhiker  0.00560989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  26.78 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  25 
 
 		 621 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  28.62 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  26.38 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  29.91 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.15 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.04 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  23.13 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  26.54 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  33.66 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  29.1 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  30.96 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.87 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.74 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  30.49 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  28.39 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.96 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.63 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.28 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  30.31 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.78 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  28.25 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.17 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  32.77 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  31.84 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.06 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>