277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3693 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  100 
 
 		 321 aa  674    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  30.82 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  29.69 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  26.62 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  29.97 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2215  hypothetical protein  28.08 
 
 		 621 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000394108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  26.06 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  26.06 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  26.06 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  25 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  26.06 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  25.83 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  28.09 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  23.74 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  25.1 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  25.47 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  23.13 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  23.65 
 
 		 449 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  21.43 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  24.88 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  24.88 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  24.59 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  24.88 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  24.84 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  25.79 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  25.79 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  25.79 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  25.79 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  22.81 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  21.11 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  23.21 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  28.95 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  21.4 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  28.95 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  26.67 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  22.15 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  22.7 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  21.89 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  24.83 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  23.76 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  25.56 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  23.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  23.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  23.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  23.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  23.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  23.5 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  24.89 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  24.89 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  22.92 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  21.18 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.25 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  23.16 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.52 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  23.1 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  27.39 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.64 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  21.83 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.48 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  23.11 
 
 		 468 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.64 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  26.46 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  22.33 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  23.81 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.39 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  23.51 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.32 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  24.01 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0993  integrase family protein  23.97 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00576914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  23.81 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  23.92 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  22.45 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  23.89 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  21.51 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.05 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  23.53 
 
 		 457 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.73 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  23.94 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  28.38 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  25.87 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  21.01 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  23.05 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  23.76 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  24.29 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  24.12 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  24.73 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  24.73 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>