More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5349 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5349  integrase family protein  100 
 
 		 313 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2007  integrase family protein  100 
 
 		 313 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2229  integrase family protein  100 
 
 		 313 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.73098 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  88.82 
 
 		 313 aa  567  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  79.87 
 
 		 313 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5407  phage integrase family protein  65.03 
 
 		 312 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1272  phage integrase  39.74 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0100836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6201  phage integrase family protein  43.38 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0371  integrase family protein  39.07 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.366696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0776  integrase family protein  40.5 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  36.39 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  36.71 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  35.46 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4898  integrase family protein  34.32 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5938  phage integrase family protein  34.53 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  37 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  37 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  36.72 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.46 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2282  integrase family protein  34.56 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  37.17 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2983  integrase family protein  34.53 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1216  integrase family protein  34.53 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4386  integrase family protein  34.53 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4358  integrase family protein  34.53 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  32.8 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8260  integrase/recombinase  32.12 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0712  phage integrase  30.67 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0244  integrase family protein  34.17 
 
 		 449 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0508  site-specific recombinase, phage integrase family  30.48 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2398  site-specific recombinase, phage integrase family  30.48 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0327  integrase family protein  30.48 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0873412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0668  integrase family protein  30.48 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2030  integrase family protein  30.48 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0834  site-specific recombinase, phage integrase family  30.48 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7621  integrase family protein  29.74 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6954  integrase family protein  27.94 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7594  integrase family protein  28.92 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1334  Integrase  26.76 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.93106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1805  Integrase  26.42 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.871906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0031  Integrase  26.42 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293171  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0311  Integrase  26.42 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018395  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4019  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0739  site-specific recombinase XerD-like protein  26.32 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1435  integrase family protein  28.28 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2242  integrase family protein  23.08 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.435795  hitchhiker  0.000783825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.3 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  24.9 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.6 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.78 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.89 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3693  integrase family protein  24.88 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.26 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  29 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  27.12 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  26.78 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  29.8 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.26 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  30.11 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  26.64 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  26.56 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.34 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.1 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  27.47 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.49 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  26.22 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.33 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.86 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  28 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  26.22 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>